พ.ศ.2506    โรงเรียนได้โอนมาสังกัดเทศบาลนครกรุงเทพ เรียกชื่อใหม่ว่า 
                   โรงเรียนเทศบาลวัดคลองใหม่ และเปิดสอนชั้น  ป.5  เป็นปีแรกในปี 

 พ.ศ.2515    เปลี่ยนชื่อเป็นโรงเรียนวัดคลองใหม่

พ.ศ.2521   ได้อนุมัติให้รื้ออาคารเรียนซึ่งเป็นอาคารไม้และสร้างอาคารเรียนถาวร
                   เป็นตึก 4 ชั้น  12 ห้องเรียน ขึ้นแทน

พ.ศ.2534    ได้รับงบประมาณต่อเติมอาคารต่ออีก 4 ชั้น 8 ห้องเรียน สร้างแล้วเสร็จเมื่อ
                          วันที่ 15 เมษายน พ.ศ.2535

พ.ศ.2536    ได้รับงบประมาณสร้างบ้านพักภารโรง 2 ชั้น แบบ ศอ.192 จำนวน 1 หลัง
                          ขนาด 2 ห้องนอน ชั้นล่างเป็นส้วมนักเรียน 6 ที่นั่ง พร้อมติดตั้ง
                    มิเตอร์ไฟฟ้าขนาด 5 แอมป์ จำนวน 2 เครื่อง

พ.ศ.2539    ได้รับงบประมาณสร้างหอสมุดเฉลิมพระเกียรติกาญจนาภิเษก  รัชกาลที่ 9

พ.ศ.2545    ได้รับงบประมาณให้สร้างตึก  5  ชั้น  10  ห้องเรียน จำนวน 5,300,000 บาท

ปัจจุบัน       นางสาวมหิศร  นันตโลหิต  ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการสถานศึกษา  
                      โรงเรียนวัดคลองใหม่